Здравствуйте. Если Вы продаете долЮ, остальные доли в Вашей сделке не участвуют, то можете заявить вычет в полном объеме, т.е. 1 м.р. Если продаются долИ, т.е. в Вашей сделки участвуют другие доли от имущества, то вычет 1 м.р. будет пропорционален размеру принадлежащей Вам доли. Например, Ваша доля 1/3, вычет будет 1 м.р. / 3 = 333 т.р.

Фактически до 1млн. не облагается НДФЛ..

Добрый вечер.
3 года для дарения от члена семьи и (или) близкого родственника;
5 лет - для остальных случаев дарения и при условии не единственного жилья (ст. 217.1. НК РФ).
При продаже ранее минимального предельного срока владения налогоплательщик вправе применить: стандартный налоговый вычет в размере 1 млн. рублей, либо расходы дарителя на приобретение доли (для случаев дарения от члена семьи и (или) близкого родственника), либо вычесть в качестве расходов сумму, с которой был уплачен налог при получении дара (= кадастровой стоимости, для случаев дарения не от близкого родственника и (или) члена семьи).
В вашем случае если дарение было от близкого родственника и (или) члена семьи и у дарителя не было расходов на приобретение доли, превышающих 1 млн., выгоднее всего применить стандартный налоговый вычет в размере 1 млн.
При продаже доли отдельным договором никаких нюансов применения стандартного налогового вычета в размере 1 млн. нет. При продаже нескольких долей/квартиры разными собственниками по одному договору - нюансы есть.